Городок Музеи раскинулся вдоль реки Чиксерри, в одноимённой долине. Существует несколько версий о возникновении этого любопытного топонима, на данный момент неподтверждённые никакими источниками. На протяжении Средних веков вплоть до XVII века городок носил название Вилла-ди-Прато. Изменение его топонима произошло единовременно с появлением здесь монахов Иезуитского ордена, следовательно многие учёные считают, что топоним произошел от слова 'lesum', которое следует читать наоборот. Согласно ещё одной гипотезе, топоним городка . это искажённое название ранее существовавшего здесь еврейского поселения 'Moisè', либо семитского термина "mosià", означающего 'обитель'.

Многочисленные нураги и следы карфагенской и римской цивилизаций свидетельствуют о том, что эта территория была заселена с древних времён, чему благоприятствовали плодородные почвы, щедро питаемые водами реки Чиксерри и её притоками. Во время существования феодальных правлений, Вилла-ди-Прато был частью куратории (административная единица в период правления юдикатов на Сардинии) Сигерро, входившей в состав Кальярского юдиката. В 1257 году Музеи перешёл в руки пизанского рода Делла Герардеска. Дошедшая до нас древняя городская структура возникла после того как семья феодалов Росселлон, которым принадлежал город, принесла его в дар Ордену Иезуитов. Монахи воздвигли на территории городка церковь и монастырь, которые вскоре обросли традиционной жилой застройкой. Порой здесь можно встретить скромные здания необычной формы, выделяющиеся на фоне традиционных типичных низких домов в кампиданском стиле, характерных для этой зоны. Скорее всего возникновение данных сооружений в городской планировке обусловлено присутствием иезуитов, которые внедрили новый архитектурный стиль (иезуитский стиль), отличавшийся от традиционного.

Заслуживает внимания живописная церковь, воздвигнутая монахами Иезуитского ордена в XVII веке, архитектурная композиция которой выдержана в стиле позднего барокко. Монахи украсили внутреннее пространство христианского храма драгоценными элементами церковного убранства, среди которых стоит отметить посерёбренный крест, который характеризует длинная вертикальная часть. В самом деле, в то время, когда городок был перестроен, на его территории были открыты мастерские по выплавке серебра, в которых изготовлялись изделия для продажи на местном рынке. Предсказуемо, что святым покровителем городка является Игнатий де Лойола, основатель ордена Иезуитов, день которого местные жители чтят 31-го июля. По этому поводу устраиваются пышные празднества, на которые съезжаются многочисленные верующие и просто гости и желающие отдохнуть из соседних городков.